Nebude to kvůli patentům (to by nemělo smysl, že, jelikož to bylo obratem nahrazeno jiným enkodérem). Pokud vím, je to proto, že FAAC má docela problémovou licenci. Úplně podrobnosti nevím, to budete muset zapátrat sám. Ale šlo o to, že FAAC je založený na kódu referenčního enkodéru, přičemž změny jsou licencovány pod LGPL. Jenže ten původní kód s LGPL kompatibilní není, takže snad ve výsledku nejde legálně distribuovat jakoukoli zkompilovanou binárku (sranda...).

Čili to byla hodně problematická komponenta a myslím, že i předtím neměli vůbec radost z toho, že to používají. Ten enkodér AAC v ffmpeg/libav už existuje řadu let, ale důvod, proč jím FAAC nahradili až dnes byla asi kvalita výstupu, který dřív byla dost špatná, takže bylo lepší použít Lame/MP3. V současnosti na něm pracuje nějaký externí přispěvatel a kvalitu teda asi vylepšil dost na to, aby na něj Handbrake přešlo? (Asi, nezkoušel jsem.)