Thunderbolt 3 tak přechází od fyzického konektoru shodného s miniDisplayPortem, k oboustrannému USB Type C konektoru. Ale i po něm, díky vysoké propustnosti USB 3.1, poběží jak datové přenosy Thunderboltu, tak grafické výstupy se dvěma displeji o rozlišení až 4096×2160 a 60Hz refreshi (DisplayPort je zde ve verzi 1.2). Nadále je zachováno řetězení zařízení za sebe, třeba připojení dvou monitorů v řetězu a jednoho úložiště na konci. Thunderbolt 3 je ze stejného důvodu kompatibilní s USB.

Ostatně jiná cesta není, některé nové počítače Apple nesou jediný konektor, a to USB Type C. miniDisplayPorty jsou minulostí, Apple udělal pragmatické rozhodnutí a v kooperaci s tím byl upraven i Thunderbolt pro svou třetí inkarnaci. Celková rychlost třetí generace dosahuje 80 Gbit/s, neboli plně duplexních 40+40 Gbit/s. Vedle úložišť a displejů podporuje Thunderbolt 3 také rychlé dobíjení výkonem až 100 W (což USB 3.x s Battery Chargingem umí ze své podstaty samo) a 10Gbit ethernet.

Rozhraní je použitelné i pro plug&play připojení externí grafiky k notebookům. Z technického hlediska se pod Thunderboltem 3 ukrývá obousměrná dvouprotokolová komunikace (PCI Express a DisplayPort), použity jsou čtyři PCI Express 3.0 linky a 8 linek DisplayPortu 1.2 (+ HBR2 / MST), nechybí již zmíněné USB 3.1 s rychlostí 10 Gbit/s, řetězení až 6 zařízení či možnost nizkolatenčního záznamu zvuku po PCI Express. Thunderbolt 3 je zpětně kompatibilní s verzemi 2 a 1. První produkty na jeho bázi bychom měli spatřit ještě před koncem tohoto roku.