Program UltraISO umí také vypalovat, takže se dá vlastně říci, že svým způsobem může nahradit běžné vypalovací programy. Soubory naházíte do projektu a ten následně vypálíte na CD či DVD. UltraISO umí také pálit „On-The-Fly“ (česky prý „letmo“, uááá, mě z té češtiny trefí! – pokud nevíte, co to znamená, tak ve stručnosti: UltraISO prostě neuloží image na disk, ale výsledek bude rovnou posílat do vypalovačky).

Vypalovat lze přímo příslušnou volbou v průzkumníku, nebo v samotném programu. Pokaždé se pak objeví dialog s možnostmi nastavení vypalování, podle toho, co je vloženo za médium.

Jako každý rozumný program si umí zjistit, zda přepisovatelný disk náhodou není prázdný, a pokud není, slušně se dotáže a pak začne mazat a následně vypalovat.

Stejně jako pro virtuální mechaniky dokáže UltraISO používat pro vypalování Nero. V konfiguraci je možné zvolit NeroAPI a pak probíhá vypalování touto cestou.

Rovněž je možné nechat nadetekovat vypalovací software a použít pak přímo tento. Pokud to tak provedete, při vypalování image se prostě zavolá Nero v celé své kráse a automaticky mu je předhozen soubor k vypálení.

Z toho také vyplývá, že touto metodou nelze pálit „On-The-Fly“, protože to už by se prakticky rovnalo spuštění Nera a vytvoření a vypálení příslušné placky přímo v něm, na to je pak UltraISO drahý nástroj, i kdyby byl za pětikorunu. Proto UltraISO v takovém případě použije vlastní funkce nebo NeroAPI, podle toho, co je nastaveno.